Богоявленский мужской монастырь с деревянным храмом Богоявления и приделом в честь Благовещения был основан в 1296 г. св. блгв. кн. Даниилом Московским. Одним из первых игуменов обители был Стефан, брат прп. Сергия Радонежского. В монастыре принял постриг свт. Алексий, митрополит Московский. Монастырь несколько раз подвергался опустошению: как во время нападения татар, поляков (в Смутное время), так и от частых пожаров, бывших в Москве в XVI-XVII вв. (в 1687 и 1737 гг.). В монастыре погребены князья Голицыны, Долгорукие, графы Шереметевы и другие представители дворянских родов. В 1812 г. монастырь был разграблен французами, однако богатая ризница, вывезенная перед приходом Наполеона из Москвы, уцелела. Первый деревянный монастырский собор был выстроен в конце XIII - начале XIV в., а каменный - в 1342 г. боярином Протасием. Его сменил собор постройки 1624 г. В 1693-1696 гг. было возведено ныне существующее здание собора, включающее в подклетной части предшествующую постройку. Собор стоит на высокой арочной подклети (позднее арки были заложены). Кровля трапезной имеет барочный фронтон. В 1747, 1749 и 1754 гг. собор получил три придела и колокольню. В 1782 году церковь была отремонтирована снаружи, оштукатурена внутри, расписана и украшена лепниною. В советское время монастырь был упразднен, собор и другие памятники архитектуры XVII в. отреставрированы, часть зданий снесена. Сломана глава храма с маковкой и крестом, что существенно исказило облик памятника. В 1929 г. храм был передан под склад "Союзхлеба", в 1931 г. - под общежитие Горного института. Спасская церковь монастыря с колокольней была сломана еще в 1920-х гг. В мае 1991 г. главный храм монастыря был возвращен Церкви, к концу года возобновились богослужения. Богослужения: ежедневно (кроме понедельника и вторника) - утреня и Литургия в 8.30, по праздникам и воскресеньям - Литургия в 6.45 и 9.30, накануне - всенощное бдение в 18 час. (зимой в 17 час.), по средам в 18 час. акаф. Казанской иконе Божией Матери. При храме действуют братство, воскресная школа, Музыкальный педагогический лицей, Московская Регентско-певческая семинария.
